Почему то много системных администраторов "забывают" (не знают), что на дисках резервируется место для root  – по умолчанию это 5% от объема диска. В современных условиях, когда диски занимают терабайты, этот резерв получается по 50Гб на каждый терабайт.

В случаях, когда пространство жизненно необходимо, либо вы изначально хотите уменьшить дисковый резерв, можно воспользоваться простой командой tune2fs.

Сокращаем резерв с 5% до 2%:

tune2fs -m 2 /dev/ваш_диск

Убираем резерв:

Подробнее